Announcement
Starting on July 4, 2018 the Indonesian Publication Index (IPI) has been acquired by the Ministry of Research Technology and Higher Education (RISTEKDIKTI) called GARUDA Garba Rujukan Digital (http://garuda.ristekdikti.go.id)
For further information email to portalgaruda@gmail.com

Thank you
Logo IPI  
Journal > BIOTROPIC The Journal of Tropical Biology > PREPARASI FRAGMEN GEN DENGAN TEKNIK ALLELE-SPECIFIC POLYMERASE CHAIN REACTION (AS-PCR) UNTUK STANDAR MARKER SNPs Human Epidermal Growth Factor 2 (HER2I655V) PADA PENDERITA KANKER PAYUDARA

 

Full Text PDF (907 kb)
BIOTROPIC The Journal of Tropical Biology
Vol 1 No 1 (2017): Biotropic, Volume 1, Nomor 1, 2017
PREPARASI FRAGMEN GEN DENGAN TEKNIK ALLELE-SPECIFIC POLYMERASE CHAIN REACTION (AS-PCR) UNTUK STANDAR MARKER SNPs Human Epidermal Growth Factor 2 (HER2I655V) PADA PENDERITA KANKER PAYUDARA
Article Info   ABSTRACT
Published date:
04 Jan 2018
 
HER2/neu merupakan anggota dari keluarga protein EerbB. Single nukleotida polimorfisme (SNP) pada gen HER2 terutama posisi kodon 655 diduga terkait dengan resiko kanker payudara. Deteksi SNP ini dapat menggunakan teknik AS-PCR (Allele Specifik Polymerase Chain Reaction) yang cukup sensitif dan spesifik namun teknik deteksi post AS-PCR selama ini yang diterapkan belum menggunakan fragmen standar gen yang menjadi target. Oleh karena itu dalam penelitian ini perlu dilakukan preparasi fragmen gen dengan teknik Allele Specific PCR untuk standar marker SNP HER2I655V. Tujuan penelitian ini untuk menyediakan standar marker DNA untuk deteksi gen SNP HER2I655V. Metode yang digunakan adalah melalui penapisan DNA, AS-PCR, elektroforesis, UV trasluminator dan spektrofotometri. Penapisan HER2I655V pada beberapa sample pGEM rekombinan dengan AS-PCR didapatkan fragmen gen HER2 genotipe AA (142 bp) dan GG (168 bp). Purifikasi fragmen menghasilkan konsentrasi akhir sebesar 37 ng/μl. Validasi fragmen HER2 dilakukan dengan menguji SNP pada 5 sampel DNA sel bukal melalui metode AS-PCR. Varian SNP pada sampel memiliki ukuran yang sama dengan standar marker HER2 untuk genotipe AA yaitu 142 bp. preparasi standar marker gen HER2I655V dengan teknik AS-PCR berhasil.
Copyrights © 2018